Identification

UMIS Number BG16RFOP002-1.005-0020-C01
Project Name Develop an innovative online platform to diagnose spinal diseases based on advanced machine learning tools
Beneficiary 206542255 Smart Soft Healthcare
Funding ERDF ==> Innovations and Competitiveness 2014-2020
Date of the Contract/Order 22.05.2018
Start Date 22.05.2018
End Date 19.10.2020
Status of Implementation of the Contract/Order of the Grant Closed (completion date)
Location of Performance
  • България, Северна и югоизточна България, Североизточен, Варна, Варна, гр.Варна

Description

Brief description
Общата цел на проекта е да се насърчи развитието и да повиши иновационния капацитет на предприятието СМАРТ СОФТ чрез подкрепа за разработване и разпространение на продуктова иновация в приоритетното направление „Индустрия за здравословен живот и биотехнологии“ – персонална медицина, а именно - CoLumbo -онлайн платформа за диагностициране на гръбначни заболявания базирана на съвременни инструменти за машинно обучение. Това направление е приоритетно за СИР – гр. Варна, където ще се развива иновацията. Разработката на иновативния продукт ще се осъществи от висококвалифицирани експерти в сферата на ИКТ и в партньорство с научна организация Технически Университет – Варна.
По своята същност CoLumbo представлява световно иновативен продукт, който въвежда на световния пазар нова услуга, която до този момент не съществува – персонализирано онлайн диагностициране на гръбначни проблеми, извършено от съвременни ИТ решения. Продуктът е базиран на уникален machine learning алгоритъм, чрез който се извършва разчитане на ЯМР (ядрено-магнитен резонанс) изображения и комбинира тази информация с информация за медицинската история на пациентите, като предоставя цялостна и с висока точност диагностика на състоянието и съвети за лечение. Иновацията представлява индустриално научно изследване.
Проектът се реализира чрез дейности по извършване на изследвания, тествания, изпитвания и измервания, свързани с разработването на иновативния продукт; създаване и тестване на бета версията на платформата; придобиване на специализирано оборудване, необходимо за разработване на продукта, както и ползване на външни услуги за научни изследвания в сферата на медицината, необходими за изработване на прототип.
Activities
  • Activity: Извършване на изследвания, изпитвания, измервания, необходими за разработването на продуктовата иновация (ще бъде извършена чрез наемането на квалифициран персонал – 9 бр. експерти и външни услуги за възлагане на научни изследвания) : Иновативността на продукта се корени в създаването на 3-степенен алгоритъм, който обединява и анализира данни от медицински изображения трансформирани и анализирани с КНМ и друга клинична информация от медицински въпросници, за да изведе цялостна и достоверна диагноза. Изключителната техническа сложност на тази иновация изисква провеждането на задълбочени проучвания и изследвания. В рамките на дейността се предвижда ангажираните експерти от Кандидата и Партньора да изпълнят следните етапи: Етап 1: Проучване, изпитване и проектиране на архитектурата на невронните мрежи (НМ), вкл. анализиране и тестване на два основни типа алгоритми – end-to-end и multitask training; измервания относно броя на входните данни, необходими за трениране на алгоритмите, както и времето, необходимо на всеки един от алгоритмите да изведе крайния резултат. Етап 2: Научно изследване на типовете features, с които ще се работи - четири основни вида: „features trained from scratch“, „handcrafted features“, „features based on auto encoders“ и „features based on transfer learning“. В зависимост от резултатите, ще се проведе и изследване на вида на НМ от гледна точка на тренираността й. Възможните варианти са full pre-trained model, fine-tuning the last layers of a pre-trained model и training from scratch. За правилното определяне на най-подходящия ще бъдат проведени обстойни изследвания с всеки един от възможните варианти. Етап 3: Проучване на предимствата и недостатъците при използването на подходите „skip connections“ и „high level features“ чрез дефинирането на математическите формули и логически връзки в платформата. Изпитванията ще бъдат фокусирани върху това дали се получават по-точни резултати, когато данните и от ЯМР изображенията и от медицинския въпросник се вкарат заедно като входни данни в НМ или когато най-напред се анализират данните от изображението и след това се вкарат данните от въпросника. Етап 4: Научно изследване и изпитване на методите за интеграция на данните от ЯМР изображенията и медицинските въпросници. Създаването на 3-степенния алгоритъм за интегриране на двата вида данни, които системата ще използва за решаване на проблема, е една от най-важните стъпки в разработването на продуктовата иновация. Експертите ще проведат задълбочени проучвания и изследвания на вариантите за представяне на информацията и калкулиране на данни от въпроси с фиксирани и отворени отговори. Особено внимание ще се обърне на методите за определяне на сериозността на медицинския проблем в зависимост от получените данни. Етап 5: Изследване, изпитване и разработване на алгоритмите и софтуерните функционалности на уеб базиран медицински въпросник и извличане и визуализация на данни чрез стандарта DICOM, необходими при интеграцията на информацията чрез три степенния алгоритъм. Етап 6: Изследване, изпитване и създаване на потребителски интерфейс, включващ общ изглед и потребителска функционалност на приложението. В рамките на дейността е необходимо да се възложат външни услуги за научни изследвания в сферата на медицината, които да включват: изследване и създаване на методологията на медицинските въпросници, разчитане, класифициране и сегментиране на множеството ЯМР изображения и съпоставяне с клинична картина с цел получаване на необходимите данни за обучение на системата. Тази услуга е специфична и изисква изпълнителят да има необходимата квалификация и опит в сферата неврохирургията и радиологията с оглед създаване на точна и качествена база данни от класифицирани изображения, необходима за успешното интегриране на самообучаващия се алгоритъм в платформата. Резултатите от външните услуги ще бъдат използвани от експертите в Етап 4. Стъпки на изпълнение на дейността: 1. Подбор на квалифициран персонал (1-ви и 2-ри месец) 2. Период на заетост на наетия персонал (от 3-ти до 14-ти месец) 3. Избор на изпълнител Външни услуги и сключване на договор (от 1-ви до 7-ти месец) 4. Изпълнение на услугата от избрания изпълнител (от 8-ми до 14-ти месец), Contracted Amount: 164 759.51 , Reported Amount: 169 328.14
  • Activity: Създаване и тестване на прототип, свързан с разработването на продуктовата иновация (ще бъде изпълнена чрез наемането на квалифициран персонал – 6 бр.): След изпълнението на изследванията и изпитанията по Дейност 1, експертният екип ще разполага с достатъчно информация и данни за отделните аспекти на продуктовата иновация (архитектура, алгоритми и т.н.), за да може да пристъпи към следващата стъпка в разработването на иновативния продукт, а именно – създаването и тестването на прототипен образец. В рамките на Дейност 2 ще бъде създадена тестова (бета) версия на платформата CoLumbo като експертната работа ще се състои от следните етапи на действие: (1) Създаване на тестова (бета) версия на продуктовата иновация. (2) Детайлизиране на варианти за тестване на отделните елементи и на продуктовата иновация като цяло. (3) Уточняване и промени в структурата, ако това се налага от технологични проблеми, възникнали в процеса на програмиране. (4) Първоначално тестване на прототипния образец – разграничаване на конкретни случаи на заболявания – например на херния (от тези без херния) на дискове с предварително отделен L5-S1 на ЯМР изображението. Последващо тестване на бета версията на платформата – диагностициране на гръбначни изменения и поставяне на диагноза на базата на ЯМР изображения и медицински въпросници. (5) Тестване на продуктовата иновация и модулите й в офлайн режим. (6) Тестване на продуктовата иновация и модулите й в онлайн режим. За целите на дейността, създаденият прототипен образец ще бъде бета версия на продукта за уеб базирана платформа. Тестовата версия ще включва всички основни модули и функционалности на платформата, за да се постигнат максимално точни и достоверни резултати при тестването. За целите на първоначалното тестване, системата ще бъде захранена с резюмирани ЯМР изображения на 150 пациента с предварително отделени L5-S1 области на изображенията. При последващото тестване, системата ще бъде настроена сама да разпознава изменения в целия гръбначен стълб без предварително сегментиране на изображенията. За да се тества процеса по анализиране и обединяване на данните от различните видове източници на информация, към 150-те ЯМР изображения ще бъдат добавени и 150 медицински въпросника, на базата на които системата трябва да изведе крайна диагноза. По време на тестванията, екипът от експерти ще следи внимателно за всякакви потенциални грешки и ще предприеме коригиращи действия по отстраняването им. Този етап изисква технологично време и голяма прецизност от страна на екипа. Стъпки на изпълнение на дейността: 1. Период на заетост на наетия персонал (от 15-ти до 24-ти месец). Наетият персонал се състои от същите експерти, ангажирани на трудови договори през първата дейност в периода от 1-ви до 2-ри месец., Contracted Amount: 57 972.81 , Reported Amount: 47 267.22
  • Activity: Придобиване на дълготрайни материални активи (ДМА), необходими за разработването на продуктовата иновация.: За изпълнението на дейностите по извършване на изследвания, изпитвания, измервания, необходими за разработването на продуктовата иновация и създаването и тестването на прототипен образец, е необходимо да бъдат придобити следните инвестиции в ДМА: 1) Компютърна конфигурация (1 бр.), необходима на програмистите при дейностите за изследване и създаване на алгоритъма за интеграция на данните от ЯМР изображенията и медицинските въпросници; изпитване и създаване на потребителски интерфейс на платформата; създаването на тестовата (бета) версия в офлайн и онлайн режим. Тази компютърна конфигурация е представлява висок клас технология, тъй като е необходимо да притежава мощен процесор, голяма памет и графични (видео) карти с висока производителност. Тези характеристики са от съществено значение при дейностите по изпитвания, създаването на софтуерния алгоритъм за интеграция на данни едновременно от два източника и тестването на бета версията на продукта в два режима (офлайн и онлайн). 2) Сървърна система (1бр.), която е необходима за функционирането и съхранението на базата данни от множество ЯМР изображенията и сорс кодовете, свързани със същинското програмиране и създаване на потребителски интерфейс на платформата и разработката на тестовата (бета) версия. Стъпки на изпълнение на дейността: 1.Избор на изпълнител за доставка на ДМА (от 1-ви до 4-ти месец) 2.Сключване на договор/и и доставка на активите (от 4-ти до 6-ти месец) , Contracted Amount: 31 199.03 , Reported Amount: 27 694.12
  • Activity: Визуализация на проекта: Целта на дейността е да се осигури необходимата информация и публичност за резултатите от реализирането на проекта. Част от ангажиментите, свързани с изпълнението на дейностите по проекта в рамките на настоящата процедура за безвъзмездна финансова помощ са свързани с осигуряване на необходимата публичност и информираност относно проектната инициатива и осигурения финансовия принос на Европейския фонд за регионално развитие чрез Оперативна програма „Иновации и конкурентоспособност” 2014-2020 г. В тази връзка всички планирани дейности за визуализация са в съответствие с приложимите правила за информиране и публичност, предвидени в Регламент (ЕС) № 1303/2013 и „Единния наръчник на бенефициента за прилагане на правилата за информация и комуникация" 2014-2020 г. За осигуряване на необходимата публичност относно изпълнението на проекта, СМАРТ СОФТ планира следните мерки: 1) Поставяне на информационен плакат на видно място в офиса на изпълнение на проекта в гр. Варна. 2) Поставяне на цветни стикери върху всеки актив, закупен по проекта, включващи информация за финансовия принос на ЕС чрез ОПИК. 3) Всички писмени материали и документи, изготвени за нуждите на проекта ще информират за финансовия принос на ЕС чрез ОП „Иновации и конкурентоспособност“ 2014-2020 и ще бъдат обозначени съгласно приложимите правила за информиране и публичност на ЕС., Contracted Amount: 0.00 , Reported Amount: 0.00

Participating Organizations

Partners
  • Partner: Technical University - Varna, Contracted Amount*: 8 983.40 , Reported Amount: 20 998.50
Contractors
  • Contractor: TAMAREL Ltd., Contracted Amount*: 36 813.02 , Reported Amount**: 46 016.26
  • Contractor: ARDES INFORMACIONNI TEHNOLOGIY, Contracted Amount*: 19 385.88 , Reported Amount**: 27 694.12
Subcontractors None
Members of the Consortium None

Notes:

* The projected contract value may be lower than the reported one because of any of the following reasons:

  • For physical person, the contracted value does not include the employer expenses, which are admissible expenses and are accounted under the project
  • The Beneficiary has reported expense only with an invoice without a contract with the selected contractor
  • The beneficiary has reported over again expenses to the MA

** This column represents the amount of costs claimed by the beneficiary

Indicators

Indicator 1 Финансирани проекти за еко-иновации, Measure Unit: Number, Base Value: 0.00 , Target amount: 1.00 , Reached amount: 1.00
Indicator 2 Private investment matching public support for innovation or R&D projects (all activities), Measure Unit: евро, Base Value: 0.00 , Target amount: 57 756.20 , Reached amount: 54 948.16
Indicator 3 Number of enterprises cooperating with research institutions (Activites 1 & 3), Measure Unit: enterprises, Base Value: 0.00 , Target amount: 1.00 , Reached amount: 1.00
Indicator 4 Number of enterprises receiving support, Measure Unit: enterprises, Base Value: 0.00 , Target amount: 1.00 , Reached amount: 1.00

Financial Information

Total Project cost 253 931.37 EUR
Grant 196 175.16 EUR
Self amount 57 756.21 EUR
Total actual amounts paid 189 512.43 EUR
Percentage of EU co-financing 85.00 %

Financial Corrections

None

Notes:

1 The quoted value represents the maximum amount of the imposed financial correction. Depending on the performance of the contract, the actual amount of the deducted financial correction may be lower.

2 A financial correction with a zero total value means that it has been canceled as a result of a court judgment.

Procurements

Procedure 1 Subject to due process: Външни услуги за научни изследвания, необходими за разработването на продуктовата иновация, Estimated Amount: 46 016.27
  • Differentiated position 1: Външни услуги за научни изследвания, необходими за разработването на продуктовата иновация
    Contractor: TAMAREL Ltd.
    Contract total funded value: 36 813.02
Procedure 2 Subject to due process: Доставка на ДМА по обособени позиции: Обособена позиция 1: Компютърна конфигурация 1 бр. Обособена позиция 2: Сървърна система 1 бр. , Estimated Amount: 31 199.03
  • Differentiated position 1: Обособена позиция 1: Компютърна конфигурация 1 бр.
    Contractor: ARDES INFORMACIONNI TEHNOLOGIY
    Contract total funded value: 5 964.77
  • Differentiated position 2: Обособена позиция 2: Сървърна система 1 бр.
    Contractor: ARDES INFORMACIONNI TEHNOLOGIY
    Contract total funded value: 13 421.11

Notes:

All amounts are in euro (EUR) / 1 EUR = 1,95583 BGN